Em 1967 foi criada na cidade de Santos a primeira cooperativa Unimed, iniciando no Brasil uma das mais bem sucedidas iniciativas de proporcionar trabalho e remuneração justa ao médico e saúde de qualidade a uma grande parcela da população. Aos poucos foram sendo abertas outras cooperativas que passaram a constituir o Sistema Unimed.
Em 11 de agosto de 1992 foi a vez de nossa região ter uma Unimed para chamar de sua. Nessa data, 24 médicos assinaram a ata de criação da Unimed Barra do Piraí, que abrangeria também as cidades de Vassouras, Piraí, Mendes e Engenheiro Paulo de Frontin. 
Com uma sede alugada na praça Nilo Peçanha, no centro de Barra do Piraí e contando com apenas dois funcionários, a cooperativa começou a crescer. Já em 1994 obteve sua primeira grande conquista. Dois contratos fechados com a Metalúrgica Barra do Piraí e a Thyssen trouxeram 6 mil clientes, mais do que dobrando sua carteira. No fim desse mesmo ano, a Unimed Barra do Piraí já estava em sua sede própria, na praça Oliveira Figueiredo, nº 50, em Barra do Piraí. A mudança para a nova sede marcou também o início do processo de informatização, indício de que a cooperativa crescia em volume e complexidade.

Com o desenvolvimento da cooperativa foram necessárias novas expansões de suas unidades. Em 1995 foi inaugurada a filial Vassouras. Em 1998 a sede expandiu para um novo imóvel contíguo e em 2003 foi inaugurada a filial Piraí. No ano seguinte foi erguido um auditório na sede, que passou a receber as assembleias, cursos e palestras. Além da estrutura administrativa, outros serviços foram criados como a medicina ocupacional, em 1996.
Buscando traduzir melhor a representação em relação aos municípios que a integram, em 2007 a Unimed Barra do Piraí passou a chamar-se Unimed Centro Sul Fluminense. Atualmente possui quase 15 mil clientes e 185 cooperados. Em 2006 e 2008 ficou entre as melhores Unimeds do Brasil através do IDSS, instrumento criado pela ANS que analisa itens como a saúde financeira, serviços prestados e formação de dirigentes da cooperativa.
Em 2013 foi inaugurado o Unimed 24 Horas que presta atendimento de urgência e emergência sete vezes por semana, 24 horas por dia. Anexo à Santa Casa de Barra do Piraí, possui estrutura independente e oferece suporte médico em pediatria e clínica médica. Dois anos depois, a unidade foi ampliada e em 2017 recebia uma ala de internação. 
O sucesso alcançado com os recursos próprios, encorajou a abertura, em 2019 da Unidade de Oncologia. Com estrutura completa e equipe especializada, oferece um tratamento próximo e humanizado ao paciente oncológico. No ano seguinte foi criado o Serviço de Remoção que conta com duas ambulâncias, sendo uma delas uma UTI móvel.

Em 2021 foi inaugurado o novo Centro Administrativo, localizado num amplo espaço de 2.500m². Ele integra de maneira mais eficiente todos os setores operacionais, além de oferecer estrutura para eventos e uma área livre, para futuras expansões. O projeto também contou com soluções inovadoras de infraestrutura, que facilitarão manutenções e alterações na planta. O meio ambiente também não foi esquecido. a estrutura conta com 300 painéis solares capazes de fornecer energia limpa e um sistema que recolhe água dos aparelhos de ar-condicionado para aproveitamento nos sanitários.

Em 2022 foi inaugurado o Laboratório Unimed, localizado na antiga sede. O novo laboratório veio aumentar a qualidade do atendimento, trazendo mais tranquilidade e segurança para médicos e pacientes. Ele se destaca pelo atendimento humanizado e pela praticidade.
Temos orgulho de nossa história e certeza que ainda temos muito por fazer. Como médicos, o dever de cuidar da saúde. Como cooperativa, a responsabilidade de contribuir para nossa sociedade.

A Unimed Centro Sul Fluminense tem como área de atuação os municípios de Barra do Piraí, Vassouras, Piraí, Mendes e Engenheiro Paulo de Frontin.  Eles estão localizados no Vale do Paraíba Sul Fluminense, uma das regiões de economia mais dinâmica do estado do RJ, composta por indústrias, pecuária e um importante polo de serviços. Também se caracteriza por ser uma região com vocação turística, seja por suas belezas naturais e clima ameno, como também por suas raízes históricas ainda presente no casario, igrejas e fazendas que datam do ciclo do café, que dominou a região no século XIX, durante o Império.