O São Joaquim Hospital e Maternidade conta com Centro Cirúrgico distribuído em 8 salas cirúrgicas, altamente equipado para procedimentos de todas as especialidades, pequeno, médio e grande porte, alguns realizados exclusivamente pelo Hospital e com recursos técnicos para qualquer tipo de intervenção.

São cerca de 15 mil procedimentos cirúrgicos realizados anualmente, entre eles, cirurgias gerais, cirurgias plásticas, urológicas, oncológicas, ginecológicas, oftalmológicas, ortopédicas e demais especialidades, além dos pequenos procedimentos.